More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3020 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 738 aa  1520    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  45.53 
 
 		 710 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  52.6 
 
 		 695 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  51.75 
 
 		 774 aa  600  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  50.43 
 
 		 653 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  50.62 
 
 		 800 aa  596  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  50.18 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  32.08 
 
 		 683 aa  318  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  32.57 
 
 		 683 aa  317  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  28.7 
 
 		 741 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  28.44 
 
 		 741 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  32.32 
 
 		 646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.38 
 
 		 643 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  30.11 
 
 		 689 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  30.79 
 
 		 689 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  28.78 
 
 		 741 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 669 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 734 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  32.48 
 
 		 619 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  31.96 
 
 		 706 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  29.84 
 
 		 748 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  29.25 
 
 		 734 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 734 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 734 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 734 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 734 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  29.38 
 
 		 734 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  28.96 
 
 		 734 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  29.57 
 
 		 774 aa  280  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  29.28 
 
 		 731 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  31.71 
 
 		 668 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  29.85 
 
 		 661 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  32.82 
 
 		 668 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  34.51 
 
 		 615 aa  275  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  29.99 
 
 		 731 aa  275  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  29.7 
 
 		 692 aa  275  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 661 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  29.71 
 
 		 767 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  34.97 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 		 788 aa  271  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  31.46 
 
 		 642 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  31.63 
 
 		 757 aa  270  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  33.52 
 
 		 609 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  31.69 
 
 		 668 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  34.45 
 
 		 778 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  32.09 
 
 		 618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.45 
 
 		 907 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.8 
 
 		 730 aa  268  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  29.46 
 
 		 767 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 703 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  32.61 
 
 		 619 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 725 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  29.25 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  30.89 
 
 		 754 aa  265  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  28.26 
 
 		 709 aa  264  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  32.92 
 
 		 617 aa  264  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  29.09 
 
 		 724 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  32.92 
 
 		 617 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.27 
 
 		 756 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  33.28 
 
 		 572 aa  263  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 755 aa  262  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  27.95 
 
 		 771 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  34.27 
 
 		 792 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  29.72 
 
 		 641 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  31.97 
 
 		 921 aa  260  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  31.87 
 
 		 618 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  34.1 
 
 		 794 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  32.18 
 
 		 616 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 838 aa  258  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  34.43 
 
 		 841 aa  258  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  32.3 
 
 		 617 aa  257  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  30.57 
 
 		 645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  32.23 
 
 		 687 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  34.24 
 
 		 841 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  34.24 
 
 		 841 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  32.89 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 		 646 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  32.76 
 
 		 1057 aa  254  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  32.49 
 
 		 655 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  33.06 
 
 		 790 aa  254  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  32.74 
 
 		 610 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  31.42 
 
 		 699 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  32.02 
 
 		 694 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  30.24 
 
 		 754 aa  252  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 684 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  32.51 
 
 		 688 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.27 
 
 		 678 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 694 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.59 
 
 		 872 aa  251  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  33.79 
 
 		 896 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  35.33 
 
 		 678 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  33.79 
 
 		 858 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  33.79 
 
 		 930 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>