More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3430 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  100 
 
 		 921 aa  1904    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05480  Vgr-related protein  62.35 
 
 		 760 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  59.1 
 
 		 706 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  59.4 
 
 		 706 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  60.14 
 
 		 700 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  58.61 
 
 		 706 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  58.61 
 
 		 706 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  57.81 
 
 		 716 aa  815    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.76 
 
 		 683 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.93 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  34.66 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  37.96 
 
 		 732 aa  363  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  35.59 
 
 		 741 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.6 
 
 		 689 aa  351  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  35.71 
 
 		 741 aa  350  9e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34.26 
 
 		 689 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  32.53 
 
 		 619 aa  346  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  34.63 
 
 		 741 aa  341  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 661 aa  332  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 661 aa  331  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 661 aa  331  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 661 aa  331  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 661 aa  331  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 661 aa  331  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.68 
 
 		 661 aa  330  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  34.01 
 
 		 774 aa  325  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  34.52 
 
 		 800 aa  320  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  37.94 
 
 		 669 aa  317  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  33.17 
 
 		 668 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  34.21 
 
 		 741 aa  314  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  31.83 
 
 		 616 aa  314  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.39 
 
 		 668 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  33.57 
 
 		 695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.56 
 
 		 703 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  34.64 
 
 		 653 aa  307  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.36 
 
 		 618 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  34.41 
 
 		 771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.4 
 
 		 668 aa  302  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.42 
 
 		 767 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  31.56 
 
 		 618 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  34.2 
 
 		 633 aa  294  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  30.43 
 
 		 613 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  36.04 
 
 		 767 aa  293  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  30.5 
 
 		 614 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  33.62 
 
 		 633 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 633 aa  288  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  33.91 
 
 		 609 aa  287  7e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  31.84 
 
 		 692 aa  287  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  33.02 
 
 		 611 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  31.61 
 
 		 692 aa  284  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  33.21 
 
 		 796 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.93 
 
 		 853 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  32.22 
 
 		 645 aa  282  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  32.31 
 
 		 777 aa  281  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  30.3 
 
 		 780 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  32.78 
 
 		 710 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  36.11 
 
 		 730 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  32.31 
 
 		 619 aa  280  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  32.28 
 
 		 642 aa  280  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 907 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.21 
 
 		 754 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.05 
 
 		 680 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  33.93 
 
 		 616 aa  279  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  31.56 
 
 		 748 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 		 763 aa  279  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.46 
 
 		 771 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 763 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  35.23 
 
 		 729 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  31.48 
 
 		 838 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 763 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 763 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  32.74 
 
 		 618 aa  278  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 		 617 aa  277  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 774 aa  277  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  32.56 
 
 		 740 aa  277  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  35.4 
 
 		 615 aa  276  9e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  32.88 
 
 		 841 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  31.67 
 
 		 756 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 		 617 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  32.88 
 
 		 841 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  35.03 
 
 		 729 aa  276  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 740 aa  275  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 		 617 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 748 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.5 
 
 		 724 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.9 
 
 		 734 aa  274  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.6 
 
 		 754 aa  274  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  31.61 
 
 		 851 aa  274  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  32.85 
 
 		 757 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  31.22 
 
 		 656 aa  273  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.71 
 
 		 734 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  30.56 
 
 		 788 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>