More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6212 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  59.33 
 
 		 921 aa  823    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  73 
 
 		 706 aa  1047    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_003296  RS05480  Vgr-related protein  56.19 
 
 		 760 aa  742    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  73.29 
 
 		 706 aa  1051    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 716 aa  1489    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  83.66 
 
 		 700 aa  1252    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  72.89 
 
 		 706 aa  1070    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  72.89 
 
 		 706 aa  1070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.42 
 
 		 683 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  33.96 
 
 		 683 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  35.37 
 
 		 741 aa  324  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  32.15 
 
 		 619 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  35.32 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.38 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.8 
 
 		 643 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.57 
 
 		 741 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  34.45 
 
 		 661 aa  308  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.77 
 
 		 689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  34.82 
 
 		 689 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  33.76 
 
 		 668 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  32.34 
 
 		 616 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  29.61 
 
 		 732 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.23 
 
 		 618 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  33.71 
 
 		 800 aa  280  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 703 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.4 
 
 		 668 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  32.6 
 
 		 774 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  32.23 
 
 		 741 aa  278  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 		 669 aa  277  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  34.62 
 
 		 616 aa  277  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  33.83 
 
 		 771 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  31.84 
 
 		 695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  32.48 
 
 		 777 aa  273  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  32.11 
 
 		 611 aa  273  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.47 
 
 		 668 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  33.71 
 
 		 710 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 780 aa  270  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  33.39 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  32.96 
 
 		 617 aa  270  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  33.39 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.37 
 
 		 614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 617 aa  267  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 734 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  31.29 
 
 		 618 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  32.04 
 
 		 653 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  32.48 
 
 		 618 aa  264  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 		 757 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  32.82 
 
 		 796 aa  263  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  33.16 
 
 		 609 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  30.83 
 
 		 642 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  30.18 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 748 aa  260  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  32.98 
 
 		 729 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  32.75 
 
 		 617 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 763 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 763 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.36 
 
 		 692 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  32.8 
 
 		 729 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 763 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  31.19 
 
 		 692 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  32.51 
 
 		 763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.48 
 
 		 771 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  32.51 
 
 		 730 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  33.1 
 
 		 610 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  31.96 
 
 		 676 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  30.97 
 
 		 734 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  31.28 
 
 		 731 aa  253  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  30.86 
 
 		 748 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 		 731 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.68 
 
 		 754 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  30.54 
 
 		 907 aa  251  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  32.58 
 
 		 767 aa  251  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.95 
 
 		 756 aa  250  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 783 aa  250  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  31.04 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 767 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 724 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 788 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 748 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  31.79 
 
 		 725 aa  248  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  30.12 
 
 		 709 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3020  Rhs element Vgr protein  32.46 
 
 		 738 aa  247  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.988422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  31.99 
 
 		 714 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>