More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0646 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  60.79 
 
 		 921 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05480  Vgr-related protein  57.79 
 
 		 760 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  83.62 
 
 		 706 aa  1186    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  82.67 
 
 		 716 aa  1214    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 700 aa  1453    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  83.64 
 
 		 706 aa  1206    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  83.48 
 
 		 706 aa  1182    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  83.64 
 
 		 706 aa  1206    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.58 
 
 		 683 aa  362  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.07 
 
 		 683 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  36.03 
 
 		 741 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  35.77 
 
 		 689 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  35.58 
 
 		 741 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  33.97 
 
 		 619 aa  326  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34.83 
 
 		 741 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  35.14 
 
 		 689 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.64 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.92 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.77 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 661 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 		 661 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  33.22 
 
 		 661 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  32.34 
 
 		 616 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  33.81 
 
 		 732 aa  296  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.32 
 
 		 703 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  33.79 
 
 		 741 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  34.07 
 
 		 774 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  32.37 
 
 		 618 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  33.81 
 
 		 668 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  34.44 
 
 		 800 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  33.8 
 
 		 695 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 757 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.84 
 
 		 734 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.51 
 
 		 669 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  33.09 
 
 		 653 aa  280  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 		 614 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.84 
 
 		 734 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  31.21 
 
 		 796 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  34.2 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  32.25 
 
 		 777 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.4 
 
 		 668 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  32.36 
 
 		 668 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  31.38 
 
 		 611 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 		 618 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 756 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  34.14 
 
 		 710 aa  270  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  32.4 
 
 		 780 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  31.34 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  31.84 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 907 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  32.74 
 
 		 616 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  32.03 
 
 		 692 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 731 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 748 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 748 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 748 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 		 748 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  32.49 
 
 		 788 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 763 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  31.95 
 
 		 731 aa  265  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  32.05 
 
 		 619 aa  265  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 763 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  33.21 
 
 		 763 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 		 748 aa  264  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 763 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  32.33 
 
 		 755 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 		 774 aa  263  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.51 
 
 		 729 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.82 
 
 		 754 aa  263  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.84 
 
 		 709 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.33 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.33 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  34.88 
 
 		 771 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  31.87 
 
 		 615 aa  260  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.45 
 
 		 730 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  31.01 
 
 		 748 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  31.22 
 
 		 645 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  31.53 
 
 		 617 aa  257  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  31.4 
 
 		 617 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  31.53 
 
 		 617 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  32.04 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  31.7 
 
 		 617 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  31.26 
 
 		 646 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 642 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.27 
 
 		 767 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  35.74 
 
 		 743 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  30.17 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  31.68 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  30.17 
 
 		 740 aa  251  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  30.45 
 
 		 724 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>