More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5259 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  58.32 
 
 		 921 aa  795    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05480  Vgr-related protein  56.87 
 
 		 760 aa  827    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0646  Rhs element Vgr protein  83.73 
 
 		 700 aa  1213    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 706 aa  1461    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  96.74 
 
 		 706 aa  1376    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  99.72 
 
 		 706 aa  1458    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  71.92 
 
 		 716 aa  1067    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  99.72 
 
 		 706 aa  1458    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  34.98 
 
 		 683 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.77 
 
 		 683 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.54 
 
 		 646 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  34.51 
 
 		 619 aa  320  6e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.17 
 
 		 643 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.27 
 
 		 689 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  35.08 
 
 		 741 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  34.36 
 
 		 741 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 661 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  31.96 
 
 		 661 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 661 aa  310  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 661 aa  310  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 661 aa  310  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 661 aa  310  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  31.8 
 
 		 661 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  31.65 
 
 		 661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  34 
 
 		 741 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.51 
 
 		 689 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1646  vgrG protein  34.08 
 
 		 800 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2758  vgrG protein  33.56 
 
 		 774 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7056  vgrG protein  33.45 
 
 		 741 aa  287  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0833871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  32.29 
 
 		 703 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  30.95 
 
 		 616 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  33.33 
 
 		 695 aa  284  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  32.57 
 
 		 757 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  32.46 
 
 		 732 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7557  vgrG protein  32.11 
 
 		 653 aa  278  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 734 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  31.77 
 
 		 611 aa  277  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  31.99 
 
 		 796 aa  277  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 734 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  34.47 
 
 		 668 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.68 
 
 		 669 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 		 763 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  33.57 
 
 		 763 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 		 668 aa  270  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  34.02 
 
 		 771 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0445  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 748 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2010  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 748 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1036  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 748 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288355  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0741  Rhs element Vgr protein  33.89 
 
 		 748 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  31.69 
 
 		 777 aa  267  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3254  vgrG protein  33.45 
 
 		 710 aa  267  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  30.43 
 
 		 618 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  32.38 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  33.13 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  31.8 
 
 		 692 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  32.49 
 
 		 731 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  31.69 
 
 		 731 aa  263  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  32.56 
 
 		 692 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  31.89 
 
 		 780 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  31.82 
 
 		 754 aa  261  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 774 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.51 
 
 		 754 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  32.59 
 
 		 756 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 788 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.97 
 
 		 748 aa  257  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  29.45 
 
 		 618 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.52 
 
 		 907 aa  257  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  31.45 
 
 		 709 aa  256  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  30.44 
 
 		 748 aa  256  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  32.58 
 
 		 771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  32.57 
 
 		 762 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1893  Rhs element Vgr protein  31.81 
 
 		 762 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  32.39 
 
 		 762 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  31.44 
 
 		 769 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.58 
 
 		 767 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  29.26 
 
 		 613 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  30.32 
 
 		 619 aa  248  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 		 642 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  32.64 
 
 		 838 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  31.68 
 
 		 706 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  29.55 
 
 		 724 aa  247  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  30.89 
 
 		 641 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  32.25 
 
 		 841 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.58 
 
 		 767 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  29.81 
 
 		 646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>