More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1509 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  47.73 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  38.91 
 
 		 593 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  38.43 
 
 		 589 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  37 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  34.62 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  34.88 
 
 		 641 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  30.7 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  34.76 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.4 
 
 		 592 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  34.63 
 
 		 606 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  32.05 
 
 		 610 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  34.74 
 
 		 602 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  31.31 
 
 		 578 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  32.41 
 
 		 574 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  35.47 
 
 		 594 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  30.43 
 
 		 565 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  34.87 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  26.55 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  30.04 
 
 		 596 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  31.4 
 
 		 602 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  30.73 
 
 		 587 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  32.51 
 
 		 596 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 615 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 		 598 aa  92  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  28.19 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  29.86 
 
 		 599 aa  89.4  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  30.74 
 
 		 599 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 589 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  29.49 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  27.4 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  29.95 
 
 		 589 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  32.66 
 
 		 605 aa  82  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  32.32 
 
 		 616 aa  81.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  29.68 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 		 589 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 617 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 642 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  30.17 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  31.38 
 
 		 576 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28.44 
 
 		 616 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 611 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  29.86 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  28.35 
 
 		 683 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  30.69 
 
 		 602 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 697 aa  72  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  28 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  33.05 
 
 		 612 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  25.47 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.31 
 
 		 618 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 621 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 694 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  26.48 
 
 		 692 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  29.28 
 
 		 599 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  29.67 
 
 		 735 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  27.84 
 
 		 683 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  26.39 
 
 		 613 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  26.56 
 
 		 792 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 655 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  32.65 
 
 		 644 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 576 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  25.36 
 
 		 687 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  28.08 
 
 		 1095 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  37.11 
 
 		 712 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  25.86 
 
 		 1017 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  29.38 
 
 		 619 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  28 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  26.51 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  26.34 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  24.87 
 
 		 692 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  24.53 
 
 		 668 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  32.48 
 
 		 714 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  24.53 
 
 		 668 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  27.01 
 
 		 730 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  24.74 
 
 		 612 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  29.67 
 
 		 349 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  22.7 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  22.77 
 
 		 928 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.6 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  29.12 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  23.91 
 
 		 782 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  23.91 
 
 		 782 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  26.19 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 979 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 661 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  43.64 
 
 		 911 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  30 
 
 		 1057 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 661 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 661 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  25.5 
 
 		 661 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  25.51 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  24.35 
 
 		 907 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>