29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1880 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  97.71 
 
 		 349 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  98.28 
 
 		 349 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  38.33 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  35.14 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  47.62 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  50.6 
 
 		 161 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  42.06 
 
 		 199 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  36.52 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  41.84 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  29.67 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  28.24 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  41.3 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  38 
 
 		 193 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  23.89 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  38 
 
 		 193 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 617 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 593 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  37.11 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 		 592 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  23.63 
 
 		 589 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  26.32 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 641 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  28.09 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  39.19 
 
 		 616 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  34.41 
 
 		 602 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>