75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1817 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  38.95 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  38.97 
 
 		 273 aa  121  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  39.34 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  34.31 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  42.14 
 
 		 275 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  46.23 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  41.84 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  41.84 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  41.84 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  30.99 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  30.46 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  37.08 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  27.88 
 
 		 617 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  30.89 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  27.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  23.56 
 
 		 615 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  38.75 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 593 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  28.98 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 589 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  23.71 
 
 		 578 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 576 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 641 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  33.75 
 
 		 641 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  24.32 
 
 		 596 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  25.88 
 
 		 229 aa  47.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  27.43 
 
 		 595 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.21 
 
 		 901 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.9 
 
 		 598 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  28.25 
 
 		 596 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 		 589 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  26.53 
 
 		 680 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 		 587 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  25.9 
 
 		 581 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  26.51 
 
 		 589 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  27.84 
 
 		 565 aa  45.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  22.98 
 
 		 504 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.65 
 
 		 611 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  32.53 
 
 		 610 aa  44.7  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 697 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 320 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 727 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  25.49 
 
 		 596 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 706 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  25.57 
 
 		 1095 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.26 
 
 		 968 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  30.99 
 
 		 730 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  30.99 
 
 		 785 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.35 
 
 		 975 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  25.75 
 
 		 680 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  26.39 
 
 		 808 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 615 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 609 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  31.94 
 
 		 616 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 723 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  25.86 
 
 		 275 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  27.03 
 
 		 706 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  31.21 
 
 		 1012 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  36.11 
 
 		 668 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  26.72 
 
 		 618 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 		 594 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  29.79 
 
 		 778 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  27.54 
 
 		 794 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  25 
 
 		 790 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 956 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 956 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  30.19 
 
 		 574 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  33.04 
 
 		 619 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  31.94 
 
 		 668 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  30.22 
 
 		 617 aa  41.2  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>