47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1814 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  48.21 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  41.99 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  38.73 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  37.56 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  37.93 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  38.36 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  38.12 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  42.06 
 
 		 349 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  42.06 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  41.12 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  25.4 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  24.62 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  23.83 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  41.03 
 
 		 602 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  30.22 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  30.22 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  26.8 
 
 		 610 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  27.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  38.03 
 
 		 616 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 		 602 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  24.07 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  37.8 
 
 		 592 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.99 
 
 		 593 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  26.21 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  28.97 
 
 		 275 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  40.3 
 
 		 792 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  34.44 
 
 		 794 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 589 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  34.44 
 
 		 778 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  26.56 
 
 		 320 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 756 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 		 594 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 		 748 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  35.71 
 
 		 730 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.29 
 
 		 668 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  37.14 
 
 		 907 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  32.97 
 
 		 572 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  25.87 
 
 		 606 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 		 788 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 		 774 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  39.44 
 
 		 755 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 669 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  25.52 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 785 aa  41.2  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>