112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1493 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  322  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  47.18 
 
 
199 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  48.5 
 
 
183 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  38.95 
 
 
192 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  39.88 
 
 
273 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  39.62 
 
 
275 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  38.67 
 
 
270 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  40.41 
 
 
202 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  50.6 
 
 
349 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  50.6 
 
 
349 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  49.4 
 
 
349 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  33.1 
 
 
615 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  31.03 
 
 
218 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 
229 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 
247 aa  58.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  33.57 
 
 
193 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  35.03 
 
 
212 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  34.72 
 
 
193 aa  58.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  33.55 
 
 
589 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  29.6 
 
 
248 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  28.95 
 
 
239 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 
617 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  29.25 
 
 
595 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  32.19 
 
 
216 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 
592 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  27.4 
 
 
602 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  31.87 
 
 
593 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  26.26 
 
 
596 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  30.46 
 
 
606 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  33.98 
 
 
778 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  35.87 
 
 
808 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.61 
 
 
730 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  34.18 
 
 
602 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 
596 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.01 
 
 
794 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  40.3 
 
 
792 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 
572 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 
756 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 
785 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 
587 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 
245 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 
589 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  35.9 
 
 
688 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 
788 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 
755 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  32.63 
 
 
714 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 
748 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.14 
 
 
774 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27.92 
 
 
641 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  34.21 
 
 
680 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  36.99 
 
 
689 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 
907 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  35.62 
 
 
730 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  26.17 
 
 
589 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  32.89 
 
 
697 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  32.89 
 
 
706 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  37.04 
 
 
618 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  33.77 
 
 
616 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  35.62 
 
 
729 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  35.62 
 
 
743 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  35.62 
 
 
729 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  29.6 
 
 
499 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  34.48 
 
 
741 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 
694 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 
668 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  35.62 
 
 
794 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  32.84 
 
 
668 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  32.35 
 
 
668 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  32.89 
 
 
727 aa  44.3  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 
669 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.21 
 
 
724 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  31.11 
 
 
320 aa  44.3  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  32.29 
 
 
578 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  28.17 
 
 
619 aa  43.9  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  36.71 
 
 
594 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  23.78 
 
 
598 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  40.38 
 
 
741 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  40.38 
 
 
741 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  45.65 
 
 
792 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 
676 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  35.71 
 
 
740 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  35.71 
 
 
732 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  35.71 
 
 
740 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  32.5 
 
 
611 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  36.51 
 
 
1118 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 
540 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  36.21 
 
 
725 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  31.9 
 
 
702 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  31.25 
 
 
599 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  35.62 
 
 
1003 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  34.55 
 
 
1981 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.46 
 
 
604 aa  41.2  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  33.62 
 
 
678 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.98 
 
 
680 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 
838 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  28.28 
 
 
618 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 
841 aa  40.8  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 
841 aa  40.8  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  33.67 
 
 
693 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  37.14 
 
 
567 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>