74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0853 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0853  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1493  hypothetical protein  48.5 
 
 
161 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  38.51 
 
 
270 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0821  hypothetical protein  42.77 
 
 
202 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1814  hypothetical protein  55.67 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  35.03 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1817  hypothetical protein  39.34 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3825  hypothetical protein  32.58 
 
 
349 aa  88.2  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1880  hypothetical protein  32.58 
 
 
349 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0941  hypothetical protein  32.02 
 
 
349 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00274384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  30.51 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  39.81 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  38.36 
 
 
592 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  27.66 
 
 
218 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  27.41 
 
 
248 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.66 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  27.96 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  34.78 
 
 
615 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  29.36 
 
 
578 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.76 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  26.61 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  34.25 
 
 
641 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  30.65 
 
 
245 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  35.62 
 
 
606 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  36.11 
 
 
587 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.88 
 
 
593 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  24.28 
 
 
565 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  32.43 
 
 
504 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
748 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  40 
 
 
682 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
774 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  28.77 
 
 
616 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  36 
 
 
610 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 
907 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
668 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 
589 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  31.4 
 
 
602 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 
275 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 
610 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  44 
 
 
1981 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 
589 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  24.66 
 
 
499 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  31.51 
 
 
589 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  32.95 
 
 
792 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  32.95 
 
 
794 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 
617 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  32.95 
 
 
778 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  43.48 
 
 
794 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
617 aa  42.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  40 
 
 
668 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
619 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.63 
 
 
756 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.63 
 
 
572 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
615 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
655 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  40 
 
 
668 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
678 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
618 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
617 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
617 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
617 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  42 
 
 
540 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  33.82 
 
 
714 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  44.19 
 
 
655 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
616 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 
609 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  44.19 
 
 
694 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 
699 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  27.55 
 
 
599 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  44.19 
 
 
725 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  36.92 
 
 
901 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  41.94 
 
 
975 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  38.46 
 
 
669 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>