278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2652 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2652  putativi pili assembly chaperone  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294251  hitchhiker  0.00357409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00948  predicted periplasmic pilini chaperone  99.58 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00512688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2699  Pili assembly chaperone, N-terminal  99.58 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000623101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00955  hypothetical protein  99.58 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00537151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1053  putativi pili assembly chaperone  99.58 
 
 		 245 aa  474  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000246739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1059  putativi pili assembly chaperone  98.31 
 
 		 245 aa  467  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2175  putativi pili assembly chaperone  96.51 
 
 		 229 aa  420  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.741204 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  42.17 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  41.3 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  41.83 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  43.43 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  43.43 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.91 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  31.84 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  31.84 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  31.84 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  31.84 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  31.96 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.84 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  34.27 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.18 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  30.17 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  30.63 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  30.8 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  30.8 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.92 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  30.38 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  30.8 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  33.78 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.18 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.63 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  29.52 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  34.63 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  33.33 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.78 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  31.7 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  30.94 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  30.96 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.78 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  29 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  30.96 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.94 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.94 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  30.43 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  31.78 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  31.28 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  31.28 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  28.11 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.38 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  27.9 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.51 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.69 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  31.37 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  31.37 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 275 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.63 
 
 		 231 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  27.63 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.54 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.17 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  31.82 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  27.12 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  27.63 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  27.63 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  27.63 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  30.9 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.03 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  30.14 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  27.12 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.12 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  27.12 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  27.12 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  27.12 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.44 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  29.36 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  27.12 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  29.36 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  29.36 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  27.27 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  35.62 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  28.33 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  27.56 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  26.22 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  26.22 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  26.67 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  26.22 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>