278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2175 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2175  putativi pili assembly chaperone  100 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.741204 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00948  predicted periplasmic pilini chaperone  96.94 
 
 		 236 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00512688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2699  Pili assembly chaperone, N-terminal  96.94 
 
 		 236 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000623101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2652  putativi pili assembly chaperone  96.51 
 
 		 236 aa  420  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294251  hitchhiker  0.00357409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00955  hypothetical protein  96.94 
 
 		 236 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00537151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1053  putativi pili assembly chaperone  96.94 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000246739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1059  putativi pili assembly chaperone  96.51 
 
 		 245 aa  417  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349289  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  44.75 
 
 		 245 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  45.45 
 
 		 243 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  42.79 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  44.44 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  44.44 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.29 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  32.29 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  32.29 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  32.29 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.75 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.29 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  32.42 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.53 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  31.56 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.8 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  31.78 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  30.63 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.56 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  35.12 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  32.27 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  35.12 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  31.06 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  30.05 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  31.06 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.18 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  35.12 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  34.63 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.63 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  34.63 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  34.63 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  34.63 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  31.14 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.87 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.44 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  32.44 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  31.25 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  33.18 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  33.18 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  33.18 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.48 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  28.51 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  30.43 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  28.51 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.87 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  30.84 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  30.84 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  30.84 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  28.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  28.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  29.65 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  28.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  30.84 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  28.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.92 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  28.51 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.27 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  29.13 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  28.21 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  29.82 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  29.82 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.4 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.18 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  30.9 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.6 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  28.09 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.63 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  28.44 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  27.63 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  27.63 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  27.63 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  27.63 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.48 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  27.27 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.31 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  28.44 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  28.44 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  28.9 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>