More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0284 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0284  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
462 aa  920    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
759 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
654 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.26 
 
 
630 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 
714 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1418 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
873 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.19 
 
 
1081 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
647 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
1021 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
1428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
682 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3457  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1070 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
796 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2659  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
1070 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.337944  normal  0.276356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
634 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
803 aa  195  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2234  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
935 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1122 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 
673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
926 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3560  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
712 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348943  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
796 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
936 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.83 
 
 
989 aa  185  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1432 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
838 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 
817 aa  183  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
1113 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
1344 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
703 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
657 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
819 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1176 aa  181  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
849 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
637 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
814 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 
1053 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
1132 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
1108 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
661 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1222 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
490 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.84 
 
 
916 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1102 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
812 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
822 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0319  histidine kinase  36.59 
 
 
707 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  37.4 
 
 
1065 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
740 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
650 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  39.11 
 
 
654 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
1065 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0297  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
711 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.219152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0308  histidine kinase  36.18 
 
 
707 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
645 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1260 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
994 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1076 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  32.93 
 
 
529 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
953 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  34.17 
 
 
654 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  38.37 
 
 
824 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
576 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
522 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
632 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
639 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
859 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
741 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
853 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  40.79 
 
 
749 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
885 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
559 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  36.89 
 
 
726 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
1105 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
845 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
983 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
845 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1106 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1034 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  40.09 
 
 
527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
758 aa  166  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
840 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
828 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
1260 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
962 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2824  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1018 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0209449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  30.21 
 
 
594 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
1279 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
711 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
546 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00154548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
557 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1180 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
817 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  35.04 
 
 
872 aa  163  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
946 aa  163  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
766 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
769 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1124 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>