More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1092 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1092  response regulator receiver protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  61.68 
 
 		 544 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.33 
 
 		 893 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.37 
 
 		 882 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 685 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.48 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 		 1313 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  48.54 
 
 		 550 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.11 
 
 		 801 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.17 
 
 		 899 aa  108  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 1691 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  48.6 
 
 		 667 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  48.6 
 
 		 667 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.53 
 
 		 1260 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  46.23 
 
 		 445 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.04 
 
 		 1075 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 1177 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.73 
 
 		 1271 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.79 
 
 		 1118 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 1101 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 927 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 		 791 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 911 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.11 
 
 		 1049 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 		 1116 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 		 1027 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 968 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  44.12 
 
 		 462 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  48.51 
 
 		 1683 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 969 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 		 923 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.28 
 
 		 957 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 592 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 923 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  46.32 
 
 		 942 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 948 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  46.32 
 
 		 962 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.24 
 
 		 928 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 		 1234 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 		 674 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 923 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 997 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1064 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.5 
 
 		 1230 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 		 912 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 923 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1284 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.79 
 
 		 717 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 518 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 		 925 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 1070 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  46.53 
 
 		 1200 aa  90.9  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  43.01 
 
 		 929 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  39.64 
 
 		 1574 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  43.01 
 
 		 929 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.53 
 
 		 2213 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  41.58 
 
 		 933 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 778 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.99 
 
 		 582 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 962 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  41.9 
 
 		 1118 aa  88.2  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.98 
 
 		 1245 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 789 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  43.69 
 
 		 590 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 1768 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1120 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  45.83 
 
 		 1439 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  45.05 
 
 		 968 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.6 
 
 		 1452 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 1767 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 1767 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1223 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 916 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 785 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 		 645 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  42.06 
 
 		 1765 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1240 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 1767 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  41 
 
 		 810 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1765 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 1245 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.72 
 
 		 1177 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0286  histidine kinase  44.21 
 
 		 885 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  42.16 
 
 		 1763 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.45 
 
 		 1287 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 947 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  42.71 
 
 		 732 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1792 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  40.82 
 
 		 1390 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.89 
 
 		 973 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1786 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1784 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 1271 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1782 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1236 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 		 1039 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  39.42 
 
 		 676 aa  84.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 1771 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 		 721 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 		 1548 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>