More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4824 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 923 aa  1865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  67.68 
 
 		 929 aa  1200    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  67.68 
 
 		 929 aa  1159    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  60.43 
 
 		 962 aa  998    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  71.86 
 
 		 925 aa  1304    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  99.46 
 
 		 923 aa  1855    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  60.52 
 
 		 928 aa  1018    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  97.72 
 
 		 923 aa  1774    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  92.85 
 
 		 923 aa  1667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  54.72 
 
 		 933 aa  876    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  60.65 
 
 		 942 aa  1004    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 921 aa  343  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40.43 
 
 		 1177 aa  340  9e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 812 aa  332  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.83 
 
 		 1346 aa  327  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 977 aa  323  7e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1397 aa  322  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.27 
 
 		 765 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 		 1499 aa  317  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  36.22 
 
 		 847 aa  317  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1069 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.2 
 
 		 1763 aa  312  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1550 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  37.8 
 
 		 1322 aa  311  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1369 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 758 aa  307  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.46 
 
 		 1442 aa  305  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 835 aa  301  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1118 aa  301  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1326 aa  301  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  34.55 
 
 		 977 aa  301  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.41 
 
 		 923 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  36.88 
 
 		 750 aa  300  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1240 aa  300  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1040 aa  299  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 925 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1166 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1398 aa  299  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 1165 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 950 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1611 aa  297  7e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 705 aa  297  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1284 aa  296  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1363 aa  296  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 1768 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 1433 aa  295  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1765 aa  294  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 1240 aa  294  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 946 aa  293  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  31.55 
 
 		 918 aa  294  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 1072 aa  293  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1771 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1767 aa  291  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 1131 aa  290  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 916 aa  290  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1202 aa  290  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 1767 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.36 
 
 		 1765 aa  289  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1820 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 1767 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1255 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 784 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 1014 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  30.5 
 
 		 918 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1126 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 1782 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 1574 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1786 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  34.71 
 
 		 1001 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1792 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1582 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 929 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 801 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.15 
 
 		 2035 aa  283  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.05 
 
 		 1331 aa  281  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1310 aa  281  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 936 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  31.07 
 
 		 861 aa  280  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1033 aa  279  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 876 aa  279  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 770 aa  276  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  34.89 
 
 		 1407 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.91 
 
 		 917 aa  275  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  26.75 
 
 		 1042 aa  275  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 816 aa  275  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1090 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.38 
 
 		 917 aa  274  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 914 aa  273  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  33.78 
 
 		 1030 aa  273  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1788 aa  273  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1305 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.21 
 
 		 933 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 		 1109 aa  271  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.13 
 
 		 1287 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 818 aa  270  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1172 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1548 aa  268  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 818 aa  268  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 833 aa  267  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>