More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0706 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  59.59 
 
 		 933 aa  995    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.32 
 
 		 923 aa  1048    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  60.32 
 
 		 929 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  59.96 
 
 		 929 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  72.86 
 
 		 962 aa  1280    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  61.52 
 
 		 925 aa  1102    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.21 
 
 		 923 aa  1047    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 928 aa  1874    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.88 
 
 		 923 aa  1040    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  72.97 
 
 		 942 aa  1280    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.54 
 
 		 923 aa  1052    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 812 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 921 aa  362  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.01 
 
 		 1177 aa  344  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.77 
 
 		 765 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  33.37 
 
 		 918 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.46 
 
 		 1346 aa  330  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 977 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  32.74 
 
 		 918 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 1040 aa  330  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1550 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.19 
 
 		 1499 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1397 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.59 
 
 		 847 aa  327  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.92 
 
 		 1322 aa  326  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.07 
 
 		 977 aa  323  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1069 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1369 aa  321  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 950 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 925 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1240 aa  318  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 758 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 835 aa  317  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 1284 aa  317  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 914 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 916 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1820 aa  315  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1398 aa  314  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1202 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 876 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 1014 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1118 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1166 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  31 
 
 		 914 aa  308  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.47 
 
 		 1442 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 1433 aa  307  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.19 
 
 		 923 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 936 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1326 aa  307  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.66 
 
 		 1763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1765 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 946 aa  300  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 784 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1240 aa  299  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 		 750 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1072 aa  297  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1165 aa  297  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 801 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1767 aa  295  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1131 aa  295  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1767 aa  294  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1768 aa  295  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  31.62 
 
 		 861 aa  294  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1767 aa  294  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 1574 aa  294  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.16 
 
 		 1331 aa  293  9e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.16 
 
 		 1765 aa  293  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1363 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1771 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1784 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1310 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  36.55 
 
 		 1001 aa  290  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1582 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 929 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1792 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  29.52 
 
 		 979 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1782 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1786 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1384 aa  286  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.73 
 
 		 1109 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 1033 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.77 
 
 		 917 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.26 
 
 		 1407 aa  284  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1255 aa  283  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1622 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.47 
 
 		 917 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1267 aa  280  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1340 aa  278  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  32.98 
 
 		 1351 aa  279  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 816 aa  279  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1788 aa  278  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 1548 aa  278  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.07 
 
 		 833 aa  278  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1305 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1126 aa  277  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 957 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.63 
 
 		 2035 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1090 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>