296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2098 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  77.06 
 
 		 449 aa  713    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 439 aa  897    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.85 
 
 		 445 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.4 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.1 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.98 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.59 
 
 		 443 aa  359  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.28 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.72 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  29.31 
 
 		 479 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  30.54 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.52 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  30.08 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  28.66 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.32 
 
 		 471 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  29.24 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  28.04 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  28.71 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  30.51 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  27.97 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  29.03 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  28.39 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  29.32 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  34.17 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  28.96 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  29.1 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  29.1 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  28.6 
 
 		 459 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.68 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 470 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.46 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.16 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.62 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  25.62 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  26.16 
 
 		 473 aa  86.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.4 
 
 		 462 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.82 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.55 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  24.81 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  25.49 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  23.52 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.24 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.6 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  22.11 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.04 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23.15 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  22.8 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.57 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  22.4 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  23.15 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  24.28 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25.23 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.23 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.15 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  25.08 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.36 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.5 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  24.71 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.02 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  22.3 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.92 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.92 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  22.79 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.71 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  21.79 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  26.89 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  23.06 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  23.58 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.78 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  22.48 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.88 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.18 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  21.18 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  22.43 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  22.65 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  25.23 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.11 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.23 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.23 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.23 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.23 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.23 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  23.08 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.81 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2692  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.39 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  23.66 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  24.19 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  22.28 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  25.74 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  22.45 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.04 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.72 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  22.2 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  21.18 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1292  TldD/PmbA family protein  24.02 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00918646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  23.71 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.49 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>