66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4912 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  920    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  59.08 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  55.65 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  58.95 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  60.91 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  55.43 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  57.39 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  53.17 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  51.31 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  52.75 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.41 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  51.51 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  51.72 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  49.57 
 
 		 457 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  61.14 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  49.68 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  49.68 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  47.84 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.74 
 
 		 445 aa  200  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.89 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.82 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.08 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.01 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.25 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.71 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.25 
 
 		 443 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.89 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.12 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.8 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.93 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.82 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.82 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  27.2 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.12 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  36.05 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  37.84 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  25.77 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  28.18 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  36.99 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  33.65 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  32.97 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  35.14 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  35.37 
 
 		 439 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  26.07 
 
 		 444 aa  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.18 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.29 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  32.56 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  37.88 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  36 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  26.09 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  36.36 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  25.96 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  25.96 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  25.96 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  25.96 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  25.96 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  25.96 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.24 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  34.67 
 
 		 439 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  29.03 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.41 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.71 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  19.84 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>