77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1148 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  950    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  61.83 
 
 
466 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  59.7 
 
 
478 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  59.83 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  55.65 
 
 
463 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  55.15 
 
 
479 aa  495  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  56.93 
 
 
464 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  54.55 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  51.8 
 
 
509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  50.4 
 
 
511 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.65 
 
 
471 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  51.48 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  50.21 
 
 
457 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  47.53 
 
 
457 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  48.83 
 
 
456 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  48.09 
 
 
456 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  48.09 
 
 
456 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  49.58 
 
 
459 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.06 
 
 
445 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.31 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.04 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.06 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 
443 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 
444 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26 
 
 
449 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.59 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.33 
 
 
443 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.37 
 
 
467 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 
492 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.87 
 
 
470 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.41 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  28.64 
 
 
448 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.24 
 
 
445 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  28.7 
 
 
453 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  28.92 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.64 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  27.19 
 
 
441 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  27.8 
 
 
441 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  28.7 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  28.7 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  28.7 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  28.7 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  28.7 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  28.7 
 
 
454 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  27.18 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.61 
 
 
439 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  27.99 
 
 
447 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  27.4 
 
 
453 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  21.96 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  31.97 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  28.37 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  27.78 
 
 
447 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.53 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.05 
 
 
441 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.36 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.07 
 
 
448 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.37 
 
 
438 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.08 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  25.23 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  26.47 
 
 
620 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.73 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  33.7 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 
486 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.05 
 
 
427 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  29.27 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.95 
 
 
430 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.23 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  31.17 
 
 
439 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2161  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.97 
 
 
356 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.15 
 
 
483 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  25.1 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  33.85 
 
 
448 aa  43.5  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>