65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5940 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  79.48 
 
 
466 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  100 
 
 
478 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  67.31 
 
 
465 aa  589  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  58.96 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  59.7 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  59.08 
 
 
463 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  57.94 
 
 
472 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  56.57 
 
 
509 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  58.35 
 
 
464 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.03 
 
 
471 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  53.19 
 
 
457 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  66.76 
 
 
511 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  54.19 
 
 
457 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  51.84 
 
 
457 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  51.72 
 
 
456 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  51.29 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  51.29 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  50.33 
 
 
459 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.91 
 
 
445 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
445 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.92 
 
 
443 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.66 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.57 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.49 
 
 
449 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 
444 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.27 
 
 
443 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.1 
 
 
465 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.72 
 
 
439 aa  96.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.87 
 
 
467 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.43 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  25.49 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  26.52 
 
 
447 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  26.14 
 
 
447 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.67 
 
 
445 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  27.31 
 
 
453 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.22 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  25.74 
 
 
453 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  25.1 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  27.87 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.94 
 
 
441 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  34.95 
 
 
453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  24.29 
 
 
447 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  25.95 
 
 
441 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.49 
 
 
454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.49 
 
 
454 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  27.4 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  27.49 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  27.47 
 
 
443 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  27.78 
 
 
439 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.71 
 
 
441 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  33.8 
 
 
453 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  37.1 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  24.22 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  35.06 
 
 
439 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0779  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.37 
 
 
436 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  30.77 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  33.77 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.42 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  40.74 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.85 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>