127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2716 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 443 aa  891    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.59 
 
 		 439 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.02 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.54 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.29 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.21 
 
 		 445 aa  363  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.93 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.08 
 
 		 443 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  34.71 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  31.75 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  34.7 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.87 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  33.04 
 
 		 466 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  34.48 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  34.48 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  32.76 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  31.85 
 
 		 463 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  29.18 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  33.84 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  31.72 
 
 		 509 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  32.97 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  33.33 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  29.84 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  31.18 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.11 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  31.06 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.94 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  29.22 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 		 467 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.81 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.71 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.26 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  27.74 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.1 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  26.02 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  27.51 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.42 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.86 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.7 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.2 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0543  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.34 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  28.24 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  28.24 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  26.54 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  27.98 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  26.89 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  27.98 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  27.98 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  27.98 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  25.99 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  31.16 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  25.8 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  26.1 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.09 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0947  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.75 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.250758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.88 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  25.15 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.8 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  27.76 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1541  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.81 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0734056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  23.3 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  24.47 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  27.2 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  21.7 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.13 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.16 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  24.02 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  25.31 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  24.48 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.82 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.09 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0473  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.79 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0351286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  27.73 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  25.39 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  26.79 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.17 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  25.63 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  24.17 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.74 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  28.86 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  22.75 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  24.28 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  27.08 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.45 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  19.57 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.96 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.8 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3530  PmbA/TldD family protein  22.44 
 
 		 436 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0882  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  20.09 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.4 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25.11 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.74 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.22 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.81 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  23.69 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.2 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.51 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  23.92 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>