More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0474 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  99.56 
 
 		 455 aa  914    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  100 
 
 		 455 aa  918    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.97 
 
 		 455 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  77.36 
 
 		 455 aa  719    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  56.38 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.32 
 
 		 448 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  54.28 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  54.2 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  54.84 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.36 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.55 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  53.01 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4154  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.6 
 
 		 448 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  50.8 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  50.46 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4463  pmbA protein  50.46 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0853906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  50.34 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4273  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.46 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.46 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  52.52 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.51 
 
 		 452 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.18 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.59 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  49.2 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  48.62 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  49.88 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  51.58 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.58 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.03 
 
 		 448 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  47.77 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  48.31 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  48.39 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  47.54 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  47.54 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.15 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.53 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  53.23 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  47.54 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.77 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  48.85 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.32 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.32 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.32 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0512  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.54 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  53 
 
 		 449 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.53 
 
 		 456 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  48.69 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.18 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  47.82 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  48.36 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  47.42 
 
 		 446 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.95 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.97 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.96 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  47.76 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  50.22 
 
 		 455 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3067  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.95 
 
 		 447 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  47.76 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  49.41 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1327  antibiotic maturation factor  45.43 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  49.41 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  47.23 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  47.23 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  48.81 
 
 		 446 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  47.23 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  46.27 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  46.77 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  46.27 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  46.75 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  46.27 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  46.99 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  46.99 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  47.95 
 
 		 476 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  48.42 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  46.27 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.02 
 
 		 450 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  46.02 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  46.02 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  47.85 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  46.02 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  46.02 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1274  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.59 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.277535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12740  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  51.63 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2222  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.77 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0527  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.14 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  44.96 
 
 		 440 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1040  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  44.96 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1673  pmbA protein  49.32 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.463741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.52 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1019  microcin-processing peptidase 1  47.5 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.946133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0602  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0961  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0957  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1081  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0242  pmbA protein  48.86 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  48.4 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.09 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.29 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>