138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31840 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  89.34 
 
 		 441 aa  790    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  62.56 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  63.7 
 
 		 443 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  62.33 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  61.99 
 
 		 441 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  62.1 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  61.09 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  61.15 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  60.54 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  57.14 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  49.77 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  46.8 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  49.77 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  49.54 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  49.77 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  49.54 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  49.54 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  49.54 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  47.25 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  46.8 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  45.6 
 
 		 444 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  44.69 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  39.22 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  39.14 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  38.91 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  40.77 
 
 		 447 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  34.15 
 
 		 444 aa  279  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  38.8 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.43 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.11 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.99 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.2 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.41 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.58 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.21 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.64 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  25.78 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  28.23 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.73 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.1 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.09 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  28.26 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.87 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  27.8 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.92 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  27.59 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  28.49 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  26.32 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  25.1 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  21.43 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.47 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  28.28 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.29 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25.75 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.78 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  24.44 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  35.71 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  36.11 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.47 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  26.72 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.52 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0396  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.39 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0206547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  27.89 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  32.43 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  32.43 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  31.88 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  26.83 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.06 
 
 		 462 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  27.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.39 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  32.56 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.14 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  32.24 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.42 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  26.24 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  26.24 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.14 
 
 		 448 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  25.5 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  31.76 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  28.67 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.06 
 
 		 448 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  32.14 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  28.26 
 
 		 447 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.71 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 		 479 aa  46.6  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  29.37 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  30.07 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>