99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2988 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  94.26 
 
 		 453 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  66.45 
 
 		 453 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  66.23 
 
 		 454 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  66.23 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  66.23 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  66.23 
 
 		 453 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  66.23 
 
 		 454 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  66.23 
 
 		 453 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  65.78 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  50.84 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  48.17 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  47.93 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  47.03 
 
 		 441 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  46.8 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  48.17 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  46.94 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  45.75 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  46.8 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  45.98 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  45.12 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  43.25 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  40.67 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  38.07 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  39.04 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  33.94 
 
 		 444 aa  289  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  36.85 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  35.01 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  37.19 
 
 		 454 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.05 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.01 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.51 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.54 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.6 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.08 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.44 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.91 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.78 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.99 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  26.27 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.36 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.97 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  28.1 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  25.74 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  23.66 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  27.49 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.17 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  24.29 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  23.99 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  26.12 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.39 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.57 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  27.99 
 
 		 466 aa  53.5  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1385  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.21 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000808939  normal  0.0131442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.46 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.42 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  23.89 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  23.89 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  25.36 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.15 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.22 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.77 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.18 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.69 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  37.31 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3343  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.82 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.48 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  25.35 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.72 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.45 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  29.36 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1002  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.48 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.61 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  27.45 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  26.72 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.32 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.36 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2079  microcin-processing peptidase 1  30.4 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  29.92 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.84 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.77 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  27.96 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  28.94 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  27.91 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  28.22 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  25.65 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0911  microcin-processing peptidase 1  28.95 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.29 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>