147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2122 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2122  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 409 aa  832    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000158093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0402  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.88 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.4 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.9 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.96 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.42 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.99 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.04 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1808  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.22 
 
 		 428 aa  122  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39064  normal  0.563323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  31.51 
 
 		 449 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  31.03 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0057  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.77 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.9 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.06 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.21 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0526  pmbA/tldD family protein  26.69 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1482  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.84 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.84 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.5 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  26.49 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  26 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0779  tetrahydromethanopterin S-methyltransferase  26.13 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0996671  unclonable  0.000000000000263997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.49 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.16 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.45 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.08 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2179  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.59 
 
 		 465 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.96 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2241  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.05 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0502  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.05 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.91 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_467  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.92 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2389  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.566954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  23.05 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  25.73 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.29 
 
 		 465 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1030  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.42 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0553  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.38 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  24.83 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.46 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.18 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.28 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.04 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  28.95 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  29.05 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  27.18 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  21.83 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4625  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.74 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4078  pmba protein  26.67 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  28.35 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.6 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  25.6 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  24.55 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0847  microcin-processing peptidase 1  26.92 
 
 		 448 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1014  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.85 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00863088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  22.94 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.57 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0594  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.59 
 
 		 443 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0776  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.7 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.58521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  27.11 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  28.8 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.17 
 
 		 460 aa  49.7  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  26.46 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10261  putative modulator of DNA gyrase  25.19 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1720  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.03 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  27.4 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0978  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.14 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0215485  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  26.67 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  26.67 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.75 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.77 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0865  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.619374  normal  0.968432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0071  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1348  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.8 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  28.35 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58050  PmbA protein  29.17 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0170866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.71 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.75 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5086  putative modulator of DNA gyrase  29.17 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0942  pmbA protein  26.32 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0958  putative modulator of DNA gyrase  24.19 
 
 		 450 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.07 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0719088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0949  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.32 
 
 		 448 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  25.12 
 
 		 458 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  20.6 
 
 		 445 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0982  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.94 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.98 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  25 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>