More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0778 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  913    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.56 
 
 		 442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.13 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.91 
 
 		 442 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.66 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.3 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.86 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  41.96 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.28 
 
 		 458 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.44 
 
 		 474 aa  257  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.6 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.79 
 
 		 458 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.8 
 
 		 458 aa  250  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.18 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.86 
 
 		 476 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.5 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.14 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.11 
 
 		 450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.04 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.49 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.76 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.41 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.57 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.08 
 
 		 463 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.21 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.81 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 462 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  36.6 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  36.21 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  28.92 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.37 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.52 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.11 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  32.47 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.47 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  37.21 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  37.21 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.49 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.6 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  38.67 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  37.6 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.6 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.6 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  37.98 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  38.37 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.55 
 
 		 493 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.23 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  37.4 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  37.5 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  37.11 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.13 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  37.11 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.06 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.81 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  33.24 
 
 		 498 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.12 
 
 		 470 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  38.28 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  38.28 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  38.28 
 
 		 497 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.15 
 
 		 465 aa  150  7e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.89 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 		 443 aa  149  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  31.23 
 
 		 471 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  36.26 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 		 486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  37.5 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.13 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.64 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  37.4 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.4 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  31.83 
 
 		 486 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.43 
 
 		 482 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  30.96 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.11 
 
 		 490 aa  146  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 512 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 488 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  37.21 
 
 		 480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  35.52 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.98 
 
 		 482 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 488 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  37.21 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.11 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  36.4 
 
 		 490 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  36.68 
 
 		 479 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.11 
 
 		 477 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.28 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.05 
 
 		 480 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  30.65 
 
 		 461 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  37.5 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.11 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>