More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1001 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
497 aa  995    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.32 
 
 
483 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61 
 
 
476 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 
464 aa  550  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  57.85 
 
 
467 aa  528  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.31 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.2 
 
 
460 aa  451  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.54 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.18 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  52.53 
 
 
460 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  52.43 
 
 
460 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.02 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.09 
 
 
462 aa  398  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.98 
 
 
462 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  40.26 
 
 
461 aa  346  6e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.47 
 
 
461 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.99 
 
 
462 aa  336  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 
462 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.6 
 
 
459 aa  334  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.56 
 
 
462 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.72 
 
 
470 aa  330  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.49 
 
 
459 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.04 
 
 
477 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.31 
 
 
480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  40.56 
 
 
475 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  39.79 
 
 
484 aa  307  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  40.04 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  38.41 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.04 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  40.75 
 
 
480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.04 
 
 
479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.04 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  36.63 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  40.75 
 
 
480 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  38.2 
 
 
480 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.57 
 
 
479 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.23 
 
 
480 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  38.81 
 
 
481 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  38.72 
 
 
483 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.19 
 
 
482 aa  296  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.5 
 
 
464 aa  295  9e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.96 
 
 
486 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.91 
 
 
464 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.23 
 
 
481 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.11 
 
 
491 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  41.14 
 
 
480 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  41.28 
 
 
481 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  38.69 
 
 
485 aa  293  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  40.43 
 
 
479 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 
485 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.36 
 
 
489 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  40.31 
 
 
480 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.13 
 
 
486 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.13 
 
 
486 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.53 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 
476 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  37.58 
 
 
481 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  38.91 
 
 
486 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.7 
 
 
482 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  38.6 
 
 
491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.58 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  40.31 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.19 
 
 
488 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.96 
 
 
482 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.37 
 
 
481 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  39.14 
 
 
481 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.97 
 
 
488 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  38.15 
 
 
471 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  36.58 
 
 
497 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 
496 aa  280  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  37.97 
 
 
488 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  37.87 
 
 
498 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.74 
 
 
475 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.92 
 
 
496 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  34.97 
 
 
474 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  37.66 
 
 
486 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  35.96 
 
 
497 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  34.97 
 
 
461 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.78 
 
 
462 aa  277  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  36.36 
 
 
497 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  38.77 
 
 
482 aa  277  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.24 
 
 
487 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 
482 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.24 
 
 
487 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.58 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  36.44 
 
 
481 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.04 
 
 
490 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  37.58 
 
 
470 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  34.93 
 
 
490 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.57 
 
 
481 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.34 
 
 
470 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.96 
 
 
490 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  40.57 
 
 
481 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  36.32 
 
 
481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  37.58 
 
 
470 aa  273  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.53 
 
 
482 aa  273  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>