More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0277 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 442 aa  879    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.35 
 
 		 442 aa  571  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.84 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.69 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  51.56 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.52 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  49.55 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.99 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.14 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 		 458 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.18 
 
 		 458 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.71 
 
 		 454 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.69 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.56 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  34.29 
 
 		 458 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.4 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 497 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.04 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.86 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 460 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.74 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  33.71 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.96 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.77 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  37.72 
 
 		 498 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.66 
 
 		 481 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.67 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  40.08 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  40.08 
 
 		 498 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.08 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.55 
 
 		 487 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.46 
 
 		 487 aa  166  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  36.33 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  37.93 
 
 		 486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.64 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  35.52 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  39.26 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.31 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  36.43 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.27 
 
 		 462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  35.36 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.36 
 
 		 481 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 488 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.06 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.39 
 
 		 483 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  32.51 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  38.84 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.35 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.29 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  38.28 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.15 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.4 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.05 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 490 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  36.72 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  33.33 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.07 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  38.02 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  38.19 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  37.88 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.28 
 
 		 467 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.7 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.98 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.19 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.25 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.55 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  33.51 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.47 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  37.4 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  31.55 
 
 		 486 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.48 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>