More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0896 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0896  tldD protein  100 
 
 		 460 aa  925    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  73.48 
 
 		 460 aa  695    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  84.57 
 
 		 460 aa  764    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.32 
 
 		 460 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  67.1 
 
 		 460 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  55.46 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.45 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.23 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.65 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.91 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.99 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.53 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.46 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.55 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.45 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  42.3 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  41.16 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.48 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.56 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.05 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.61 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.27 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  41.25 
 
 		 480 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.08 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.09 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  41.04 
 
 		 480 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  40.35 
 
 		 483 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.86 
 
 		 490 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  39.83 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.25 
 
 		 491 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  42.34 
 
 		 481 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  39.96 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.96 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.17 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.96 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.2 
 
 		 493 aa  315  7e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  39.18 
 
 		 480 aa  315  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.38 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.43 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  38.25 
 
 		 484 aa  313  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  42.04 
 
 		 480 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.93 
 
 		 482 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.41 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.66 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.61 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  39.87 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.27 
 
 		 482 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.32 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  39.48 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.35 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.87 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  40.49 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.72 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  41.72 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  39.26 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  39.35 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 482 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 482 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.57 
 
 		 481 aa  302  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 482 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  38.85 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.49 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.82 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  40.27 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  39.75 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  39.04 
 
 		 490 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  40.49 
 
 		 480 aa  299  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  40.04 
 
 		 497 aa  299  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  39.06 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  40 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.87 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  40.3 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  39.11 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  39.74 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  38.41 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  38.9 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  38.36 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.53 
 
 		 485 aa  296  7e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  38.41 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  38.41 
 
 		 481 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  38.69 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  40.18 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  39.32 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  38.79 
 
 		 486 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.19 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  39.6 
 
 		 482 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.38 
 
 		 482 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.25 
 
 		 482 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>