More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2721 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  97.39 
 
 		 460 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  70.15 
 
 		 460 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  69.93 
 
 		 460 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 460 aa  921    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  67.1 
 
 		 460 aa  618  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  55.68 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.61 
 
 		 469 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.87 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.51 
 
 		 483 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.11 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.54 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.92 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.17 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.64 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.85 
 
 		 491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  40.39 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.02 
 
 		 462 aa  343  4e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.6 
 
 		 461 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  43.02 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.33 
 
 		 462 aa  339  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.96 
 
 		 459 aa  339  5e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 		 480 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.69 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.89 
 
 		 462 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  41.74 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.25 
 
 		 479 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  41.49 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.86 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  41.03 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.22 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  42.47 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  41.37 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  40.35 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  41.46 
 
 		 477 aa  319  7e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  41.46 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  41.11 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.92 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  41.63 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.91 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.53 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  41.89 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 482 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  40.04 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  40.13 
 
 		 481 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 482 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 482 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.62 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.62 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  39.96 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  40.09 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.72 
 
 		 486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  39.64 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  39.96 
 
 		 497 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  40.57 
 
 		 484 aa  309  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  40.52 
 
 		 481 aa  309  8e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  40.22 
 
 		 497 aa  309  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  40.27 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.32 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  40.51 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.37 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  40.04 
 
 		 481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.09 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  38.74 
 
 		 486 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  39.96 
 
 		 482 aa  306  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  40.73 
 
 		 481 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  39.25 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.32 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  38.08 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  40.26 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.65 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  40.52 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  40.52 
 
 		 481 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  40.52 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  39.82 
 
 		 480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.09 
 
 		 496 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.74 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  40.84 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.74 
 
 		 486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.98 
 
 		 482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.17 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.75 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.74 
 
 		 508 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.84 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  42.21 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.21 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  40.3 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>