More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0070 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 459 aa  939    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  60.3 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  60.52 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.51 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.43 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.72 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.73 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.3 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.14 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  41.43 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  41.43 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  39.52 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 		 459 aa  333  4e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.69 
 
 		 460 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.33 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.49 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  39.38 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.53 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.1 
 
 		 475 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  39.08 
 
 		 460 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  39.09 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  37.53 
 
 		 484 aa  308  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.07 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.92 
 
 		 474 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  36.86 
 
 		 481 aa  299  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.77 
 
 		 474 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.79 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.48 
 
 		 486 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.84 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  40.13 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  37.47 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.34 
 
 		 470 aa  295  8e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.72 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.34 
 
 		 508 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.42 
 
 		 462 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  35.98 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.29 
 
 		 474 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  37.28 
 
 		 481 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.85 
 
 		 469 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  36.52 
 
 		 481 aa  292  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  35.85 
 
 		 483 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.02 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  36.9 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.85 
 
 		 469 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.85 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  37.18 
 
 		 490 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.53 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  37.47 
 
 		 481 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  37.69 
 
 		 490 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  37.2 
 
 		 493 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.09 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.26 
 
 		 487 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  37.5 
 
 		 481 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  37.47 
 
 		 481 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  37.47 
 
 		 481 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  37.47 
 
 		 481 aa  285  8e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.69 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.41 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.15 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.77 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.36 
 
 		 481 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  36.36 
 
 		 481 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  37.36 
 
 		 480 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.54 
 
 		 480 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.73 
 
 		 489 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.73 
 
 		 489 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  34.19 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.89 
 
 		 490 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  35.62 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  36.62 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  36.07 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.8 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  35.65 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.76 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  39.7 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  36.07 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  37.14 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  36.07 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  35.64 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  36.32 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.55 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 		 489 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  36.07 
 
 		 481 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  36.07 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  35.43 
 
 		 481 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.11 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  37.31 
 
 		 480 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.38 
 
 		 487 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  37.25 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  35.68 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.62 
 
 		 496 aa  279  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.64 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  35.64 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  36.74 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  35.64 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>