More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0542 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 475 aa  963    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  53.33 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.57 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.02 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.31 
 
 		 497 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.68 
 
 		 460 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  49.46 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.81 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  49.13 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.44 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.38 
 
 		 462 aa  382  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.55 
 
 		 459 aa  362  9e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.56 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  40.99 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.1 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.32 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.77 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.21 
 
 		 491 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.82 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 462 aa  323  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.07 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  39.23 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  40.09 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.47 
 
 		 482 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  40.09 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.1 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  40.99 
 
 		 484 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  40.09 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.15 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.15 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.15 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.15 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  38.76 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  38.97 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.94 
 
 		 482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  37.74 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  38.94 
 
 		 482 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.36 
 
 		 490 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.95 
 
 		 462 aa  312  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.94 
 
 		 477 aa  312  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  40.09 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  38.7 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.7 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  39.96 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.14 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  41.46 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  38.63 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.3 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 		 479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  39.96 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.7 
 
 		 479 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  38.63 
 
 		 480 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  39.44 
 
 		 498 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.74 
 
 		 481 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.89 
 
 		 486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.26 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  41.39 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  38.68 
 
 		 486 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.63 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.81 
 
 		 486 aa  303  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  38.79 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.85 
 
 		 508 aa  302  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  38.63 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.09 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.04 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  37.1 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  38.89 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  37.78 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.02 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  37.56 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  37.78 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.84 
 
 		 490 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.79 
 
 		 476 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.2 
 
 		 486 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  38.02 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  37.55 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  38.02 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  38.02 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  38.5 
 
 		 481 aa  299  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.15 
 
 		 487 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  39.65 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.65 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.06 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  39.82 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  38.7 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  38.56 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  40.13 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.82 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  38.2 
 
 		 488 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  36.09 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>