More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2525 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
464 aa  935    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  84.27 
 
 
464 aa  795    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.57 
 
 
462 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  48.71 
 
 
462 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.07 
 
 
465 aa  415  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  45.91 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  45.47 
 
 
461 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  47.3 
 
 
461 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  46.88 
 
 
474 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.14 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.61 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.65 
 
 
462 aa  360  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.27 
 
 
459 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  40.6 
 
 
467 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.97 
 
 
462 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.97 
 
 
483 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  38.59 
 
 
490 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.02 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.53 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.59 
 
 
469 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.53 
 
 
474 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  39.92 
 
 
489 aa  299  6e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 
476 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  36.68 
 
 
474 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.66 
 
 
460 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.2 
 
 
488 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.89 
 
 
474 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.91 
 
 
497 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  37.74 
 
 
490 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.14 
 
 
481 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 
460 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.87 
 
 
489 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.87 
 
 
489 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  38.82 
 
 
460 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 
489 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  40.04 
 
 
481 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  39.61 
 
 
460 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.32 
 
 
475 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.77 
 
 
493 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.66 
 
 
464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.06 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.24 
 
 
469 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.19 
 
 
470 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.13 
 
 
482 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.13 
 
 
482 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.13 
 
 
482 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  37 
 
 
497 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.96 
 
 
462 aa  280  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  35.86 
 
 
481 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  36.21 
 
 
481 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.31 
 
 
481 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  37 
 
 
497 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.77 
 
 
479 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 
470 aa  280  6e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.42 
 
 
470 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  37 
 
 
497 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
482 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  36.67 
 
 
475 aa  279  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  37.77 
 
 
479 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  39.07 
 
 
480 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
482 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 
508 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.77 
 
 
479 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.41 
 
 
490 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  39.07 
 
 
480 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.44 
 
 
482 aa  277  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.93 
 
 
469 aa  276  4e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  36.76 
 
 
477 aa  276  4e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.55 
 
 
479 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  38.85 
 
 
481 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 
485 aa  276  7e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  37.77 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  37.56 
 
 
480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  35.16 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.12 
 
 
486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 
479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  37.36 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  37.72 
 
 
480 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.84 
 
 
496 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  37.42 
 
 
485 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  37.47 
 
 
484 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.82 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.69 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  35.68 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  36.54 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  36.6 
 
 
493 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  37.69 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.85 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  36.21 
 
 
481 aa  273  6e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 
486 aa  272  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  36.53 
 
 
482 aa  272  9e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  37.39 
 
 
481 aa  272  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  36.6 
 
 
486 aa  272  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  36.89 
 
 
498 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>