More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09221 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  69.78 
 
 		 481 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  68.04 
 
 		 469 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  100 
 
 		 481 aa  981    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  68.55 
 
 		 470 aa  656    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  68.27 
 
 		 469 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  67.17 
 
 		 469 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  64.49 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  64.25 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  63.56 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  63.99 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  59.26 
 
 		 489 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.13 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.42 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  58.06 
 
 		 490 aa  541  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  58.46 
 
 		 490 aa  541  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.42 
 
 		 489 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.88 
 
 		 489 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.61 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.13 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  36.82 
 
 		 461 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  36.82 
 
 		 461 aa  289  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 462 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  38.31 
 
 		 474 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.63 
 
 		 462 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.19 
 
 		 462 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.21 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  37.45 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.02 
 
 		 464 aa  269  7e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.28 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  34.71 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  35.85 
 
 		 481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  32.76 
 
 		 475 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 464 aa  243  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  35.58 
 
 		 481 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  35 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  35.48 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.89 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  35.03 
 
 		 480 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.77 
 
 		 490 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  35.22 
 
 		 481 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  33.41 
 
 		 467 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  34.33 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.33 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.04 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.33 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.38 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  35.17 
 
 		 481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  35.29 
 
 		 481 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  35.23 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  35.23 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  36.45 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  34.39 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  35.23 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  33.62 
 
 		 471 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  33.97 
 
 		 481 aa  233  6e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  33.48 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  33.55 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  33.68 
 
 		 481 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  35.03 
 
 		 481 aa  233  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  233  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 		 479 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.79 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.76 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.72 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.47 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.47 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.47 
 
 		 482 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.68 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.47 
 
 		 486 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  35.67 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.27 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  32.38 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.07 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.41 
 
 		 486 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.99 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  35.47 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  35.47 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  35.47 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  35.47 
 
 		 481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  35.47 
 
 		 481 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.72 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  34.73 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  32.54 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  34.21 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  33.8 
 
 		 497 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.59 
 
 		 496 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  32.56 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  34.21 
 
 		 497 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.05 
 
 		 490 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>