More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10461 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  98.08 
 
 
469 aa  937    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.95 
 
 
470 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.74 
 
 
469 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.88 
 
 
474 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  67.17 
 
 
481 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  67.89 
 
 
474 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  68.97 
 
 
481 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  100 
 
 
469 aa  959    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.45 
 
 
474 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  65.73 
 
 
474 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  59.53 
 
 
489 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.67 
 
 
489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  58.89 
 
 
490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.67 
 
 
489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  58.67 
 
 
490 aa  560  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.89 
 
 
488 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.03 
 
 
489 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.95 
 
 
465 aa  327  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  39.96 
 
 
474 aa  309  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  38.84 
 
 
461 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  38.94 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  38.41 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.02 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.12 
 
 
464 aa  301  2e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 
462 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.87 
 
 
462 aa  293  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.85 
 
 
459 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.91 
 
 
462 aa  288  1e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.3 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  34.59 
 
 
471 aa  240  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  35.22 
 
 
481 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.5 
 
 
480 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.13 
 
 
483 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  35.87 
 
 
481 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  35.41 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  35.56 
 
 
490 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.64 
 
 
486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  36.18 
 
 
481 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  35.41 
 
 
480 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  34.93 
 
 
484 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  35 
 
 
481 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.11 
 
 
493 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  34.73 
 
 
480 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  35.5 
 
 
481 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  35.96 
 
 
481 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 
471 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 
462 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  33.11 
 
 
467 aa  229  6e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  34.43 
 
 
491 aa  229  6e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  34.05 
 
 
475 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  35.22 
 
 
481 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.81 
 
 
482 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  34.66 
 
 
480 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.09 
 
 
464 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.5 
 
 
471 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  35.75 
 
 
481 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  35.53 
 
 
481 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  35.31 
 
 
481 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  35.31 
 
 
481 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.76 
 
 
477 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  35.31 
 
 
481 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.67 
 
 
481 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  35.38 
 
 
481 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  33.9 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  35.75 
 
 
481 aa  226  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  35.31 
 
 
481 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.9 
 
 
482 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  35.54 
 
 
480 aa  226  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  34.11 
 
 
470 aa  226  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  35.33 
 
 
481 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  34.11 
 
 
470 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.99 
 
 
480 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  35.78 
 
 
480 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 
470 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  35.96 
 
 
497 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  34.58 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.48 
 
 
476 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.8 
 
 
479 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  35.09 
 
 
481 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.56 
 
 
479 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  35.56 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  35.57 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  33.05 
 
 
481 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  35.75 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.68 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  35.75 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  35.9 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.6 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.68 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  35.27 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.68 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 
475 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 
488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>