More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4759 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
488 aa  1010    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  78.73 
 
 
489 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  78.12 
 
 
490 aa  817    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  79.35 
 
 
489 aa  834    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  73.62 
 
 
489 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  76.69 
 
 
490 aa  803    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  78.73 
 
 
489 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.19 
 
 
481 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.98 
 
 
470 aa  597  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  61.67 
 
 
469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  59.1 
 
 
469 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  58.89 
 
 
469 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  60.13 
 
 
481 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  54.71 
 
 
474 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  56.11 
 
 
474 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  55.28 
 
 
474 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  54.66 
 
 
474 aa  521  1e-147  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  40.71 
 
 
474 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  40.18 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  37.74 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  37.74 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.01 
 
 
462 aa  300  5e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.2 
 
 
464 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.95 
 
 
464 aa  292  7e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.84 
 
 
465 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.53 
 
 
459 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.9 
 
 
462 aa  282  9e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.9 
 
 
462 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.93 
 
 
462 aa  272  9e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.51 
 
 
470 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  34.19 
 
 
481 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  35.51 
 
 
470 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  35.51 
 
 
470 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  33.41 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  35.38 
 
 
480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  34.35 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 
481 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  33.77 
 
 
480 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  35.1 
 
 
480 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  33.91 
 
 
481 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.29 
 
 
491 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  33.7 
 
 
481 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  34.27 
 
 
481 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.66 
 
 
471 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  35.9 
 
 
481 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  34.21 
 
 
480 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  33.26 
 
 
490 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  33.48 
 
 
481 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  35.9 
 
 
481 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.02 
 
 
475 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  34.62 
 
 
481 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  33.92 
 
 
471 aa  230  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34 
 
 
471 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  33.83 
 
 
481 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  34.72 
 
 
481 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  34.05 
 
 
481 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  34.05 
 
 
481 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  34.05 
 
 
481 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.84 
 
 
479 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.19 
 
 
479 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  33.19 
 
 
479 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.55 
 
 
479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  34.07 
 
 
472 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.68 
 
 
467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  34.76 
 
 
484 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.97 
 
 
479 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.2 
 
 
480 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  33.11 
 
 
481 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  33.56 
 
 
471 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  35.01 
 
 
481 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  34.93 
 
 
481 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  34.93 
 
 
481 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  34.93 
 
 
481 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  34.73 
 
 
481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.82 
 
 
477 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  34.72 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  32.75 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.47 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.49 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  33.84 
 
 
479 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  34.22 
 
 
475 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.69 
 
 
480 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.2 
 
 
483 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.89 
 
 
481 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 
462 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.19 
 
 
482 aa  216  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  33.76 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.85 
 
 
475 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.62 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
475 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  33.12 
 
 
483 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>