More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0490 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  65.41 
 
 		 490 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  71.88 
 
 		 481 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  100 
 
 		 481 aa  976    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  66.81 
 
 		 481 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  68.75 
 
 		 481 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.38 
 
 		 481 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  69.17 
 
 		 481 aa  669    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  70.42 
 
 		 481 aa  687    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  80.87 
 
 		 481 aa  772    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  70.83 
 
 		 481 aa  673    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  81.29 
 
 		 481 aa  776    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  70.83 
 
 		 481 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  72.08 
 
 		 481 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  71.88 
 
 		 481 aa  681    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.37 
 
 		 480 aa  674    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  68.96 
 
 		 481 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  70.62 
 
 		 481 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  69.38 
 
 		 481 aa  666    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  70.83 
 
 		 481 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  80.87 
 
 		 481 aa  772    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  67.01 
 
 		 482 aa  631  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  66.39 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  66.39 
 
 		 497 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  66.39 
 
 		 497 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.72 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.6 
 
 		 493 aa  616  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.11 
 
 		 480 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.69 
 
 		 479 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.69 
 
 		 479 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  62.08 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  65.27 
 
 		 479 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  61.26 
 
 		 481 aa  608  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.48 
 
 		 479 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.34 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  62.42 
 
 		 483 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.48 
 
 		 479 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  65.9 
 
 		 480 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  65.69 
 
 		 480 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  65.69 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  65.9 
 
 		 480 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.76 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.76 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.76 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.76 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.55 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  65.34 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.14 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  61.46 
 
 		 484 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  64.93 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  60.25 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.93 
 
 		 490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  59.88 
 
 		 480 aa  581  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  60.83 
 
 		 481 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  64.02 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  62.42 
 
 		 481 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.05 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.9 
 
 		 496 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  59.58 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.57 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  59.58 
 
 		 481 aa  558  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.58 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.54 
 
 		 490 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.32 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.34 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  58.37 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.39 
 
 		 487 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.39 
 
 		 487 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  58.3 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.75 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  58.71 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.84 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.33 
 
 		 496 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  57.88 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  57.35 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.56 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  59.41 
 
 		 486 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.73 
 
 		 488 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  56.16 
 
 		 477 aa  538  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.88 
 
 		 508 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.8 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  58.68 
 
 		 485 aa  536  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.68 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  55.95 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.88 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  58.18 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  58.18 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  58.18 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.81 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  58.18 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>