More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1710 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 465 aa  946    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.23 
 
 		 462 aa  686    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  71.37 
 
 		 462 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  71.37 
 
 		 462 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  54.01 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  53.73 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.51 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.07 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.65 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.66 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  46.02 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  46.62 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  43.71 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.72 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.14 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.01 
 
 		 483 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.07 
 
 		 460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.64 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  42.36 
 
 		 460 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.52 
 
 		 497 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  41.48 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  42.95 
 
 		 469 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  43.16 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.07 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.26 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.53 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.02 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  41.9 
 
 		 475 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.7 
 
 		 462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.85 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.61 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  40.22 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  38.77 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  39.62 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  38.41 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  40.09 
 
 		 480 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.53 
 
 		 486 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.35 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  40.26 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  38.43 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  39.26 
 
 		 481 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  40.09 
 
 		 481 aa  306  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  41.19 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.54 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.61 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  38.41 
 
 		 481 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  38.69 
 
 		 490 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.35 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  39.06 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  39.43 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.47 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.25 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40 
 
 		 486 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.18 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  38.31 
 
 		 481 aa  299  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  38.66 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.58 
 
 		 481 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  38.58 
 
 		 481 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  39.96 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.3 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.09 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  39.39 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.9 
 
 		 488 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  36.29 
 
 		 491 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  39.64 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.9 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  38.81 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.12 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  37.58 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  38 
 
 		 486 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  37.61 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  37.17 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.43 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  38.17 
 
 		 488 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.08 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.46 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  38.61 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.79 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  38.61 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.53 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.54 
 
 		 491 aa  294  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.79 
 
 		 476 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  39.18 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.08 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  38.38 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  38.38 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  38.38 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.39 
 
 		 481 aa  293  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.84 
 
 		 488 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  38.28 
 
 		 498 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  37.47 
 
 		 486 aa  292  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.31 
 
 		 486 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.28 
 
 		 474 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>