More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0009 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 462 aa  927    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.53 
 
 		 469 aa  581  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  51.1 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.78 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  51.99 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  51.99 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  50.22 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.54 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.45 
 
 		 462 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.9 
 
 		 476 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.92 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.44 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.94 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.09 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.07 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.39 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  41.56 
 
 		 479 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.34 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.34 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  41.9 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  41.39 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.47 
 
 		 480 aa  338  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  42.06 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.17 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.63 
 
 		 479 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  42.28 
 
 		 481 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  41.34 
 
 		 479 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  40.57 
 
 		 481 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 		 482 aa  328  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.4 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  40.04 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.4 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  41.54 
 
 		 480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  41.96 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  41.78 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  41.7 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  41.7 
 
 		 481 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  41.7 
 
 		 481 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  40.09 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  42.95 
 
 		 497 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.18 
 
 		 462 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  41.52 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  41.74 
 
 		 481 aa  325  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  41.52 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  41.93 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  42.14 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  41.52 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  41.52 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  41.05 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  44.07 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.22 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  40 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  41.52 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  42.73 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  42.73 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  40.77 
 
 		 480 aa  323  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.92 
 
 		 480 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  41.22 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.99 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  41.04 
 
 		 481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.43 
 
 		 486 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  41.48 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  42.73 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  40.27 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.27 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  40.58 
 
 		 481 aa  317  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  39.78 
 
 		 484 aa  316  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  41.5 
 
 		 480 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  38.89 
 
 		 481 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.58 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.06 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.51 
 
 		 490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.48 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  39.6 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.28 
 
 		 482 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.83 
 
 		 482 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.82 
 
 		 487 aa  312  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.25 
 
 		 488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  37.06 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.43 
 
 		 490 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.9 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  38.94 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.47 
 
 		 481 aa  309  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.63 
 
 		 465 aa  308  9e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.68 
 
 		 489 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.9 
 
 		 486 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  38.86 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.9 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.5 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  39.37 
 
 		 486 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>