More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1127 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.17 
 
 		 489 aa  765    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.17 
 
 		 489 aa  765    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.62 
 
 		 488 aa  742    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  73.56 
 
 		 490 aa  742    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  100 
 
 		 489 aa  1002    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  73.13 
 
 		 490 aa  738    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  76.17 
 
 		 489 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  63.03 
 
 		 470 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.31 
 
 		 481 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.77 
 
 		 469 aa  596  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  59.53 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  59.53 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  59.26 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  56.84 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  56.75 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  56.75 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  56.1 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  41.5 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  41.28 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.92 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.66 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.87 
 
 		 464 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  37.09 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  37.09 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.68 
 
 		 462 aa  282  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.62 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.77 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.64 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 		 475 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  35.08 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  34.06 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  33.96 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  36.14 
 
 		 481 aa  233  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  35.29 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  36.56 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  36.15 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  33.48 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  35.28 
 
 		 481 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  37.07 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  35.9 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  33.84 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  36.14 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.65 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  37.07 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  35.06 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  35.06 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  35.06 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.29 
 
 		 480 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  35.16 
 
 		 481 aa  226  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  33.04 
 
 		 481 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  33.84 
 
 		 481 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  35.1 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  35.1 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  35.1 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  35.1 
 
 		 481 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.47 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.91 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  31.53 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  34.06 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  34.44 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  35.1 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  34.36 
 
 		 481 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.15 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  34.88 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  32.83 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.96 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  32.9 
 
 		 477 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  35.38 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  34.96 
 
 		 481 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.55 
 
 		 459 aa  219  7e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.03 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  41.03 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.03 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.85 
 
 		 491 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  41.67 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.74 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.45 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  39.59 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.71 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  41.53 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.15 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  40.89 
 
 		 479 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.86 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.64 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.64 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.64 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.85 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.32 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  33.19 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.32 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.74 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  40.58 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  31.93 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>