More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2754 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  80.45 
 
 
490 aa  829    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  83.44 
 
 
489 aa  869    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  79.75 
 
 
490 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  80.38 
 
 
488 aa  817    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  83.44 
 
 
489 aa  869    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  76.17 
 
 
489 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 
489 aa  1012    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  58.88 
 
 
481 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  59.36 
 
 
470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  58.72 
 
 
469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  58.03 
 
 
469 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  58.03 
 
 
469 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  57.88 
 
 
481 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  55.56 
 
 
474 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  55.77 
 
 
474 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  55.77 
 
 
474 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  54.9 
 
 
474 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  40.75 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  40.44 
 
 
474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.06 
 
 
462 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 
464 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.61 
 
 
462 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.74 
 
 
465 aa  286  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.79 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  35.83 
 
 
461 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  36.7 
 
 
461 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.09 
 
 
464 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.32 
 
 
459 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 
462 aa  273  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  33.9 
 
 
467 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.55 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  34.73 
 
 
480 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.7 
 
 
462 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  32.82 
 
 
490 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  33.75 
 
 
481 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.29 
 
 
475 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  35.09 
 
 
480 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  33.48 
 
 
481 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  34.4 
 
 
481 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  33.33 
 
 
479 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
479 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  33.76 
 
 
475 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
479 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  34.8 
 
 
481 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
479 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  34.43 
 
 
481 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 
483 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  32.46 
 
 
481 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.92 
 
 
470 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  33.63 
 
 
481 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  33.48 
 
 
481 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  33.06 
 
 
481 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  32.93 
 
 
481 aa  223  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  34.07 
 
 
481 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  34.07 
 
 
481 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  34.4 
 
 
481 aa  223  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  32.97 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  34.8 
 
 
481 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.69 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  34.14 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  33.47 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.18 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  34.28 
 
 
470 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  34.28 
 
 
470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  32.39 
 
 
480 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.48 
 
 
471 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  33.33 
 
 
481 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.98 
 
 
464 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  33.92 
 
 
481 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  33.92 
 
 
481 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  33.92 
 
 
481 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  33.92 
 
 
481 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.63 
 
 
471 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.97 
 
 
482 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  33.26 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.55 
 
 
480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  32.75 
 
 
481 aa  216  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  39.87 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  34.46 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
482 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  31.21 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  39.24 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  32.39 
 
 
477 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.31 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  39.56 
 
 
480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.77 
 
 
482 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.61 
 
 
490 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  32.98 
 
 
484 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.24 
 
 
476 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>