More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1032 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.63 
 
 		 476 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 483 aa  982    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.32 
 
 		 497 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  63.4 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  62.47 
 
 		 464 aa  559  1e-158  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  54.45 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.16 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  52.93 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  54.66 
 
 		 460 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  52.51 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.79 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.89 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.92 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.32 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.74 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.13 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  42.06 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.26 
 
 		 462 aa  362  9e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  41.85 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.01 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  42.24 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.43 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.65 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.43 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  38.21 
 
 		 479 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.21 
 
 		 479 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  38.53 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  38.31 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.78 
 
 		 479 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.81 
 
 		 482 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  38.53 
 
 		 486 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.61 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  40.27 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.31 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.43 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.31 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.78 
 
 		 481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  40.27 
 
 		 480 aa  310  4e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.18 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  38.65 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  39.91 
 
 		 481 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  38.38 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.71 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  39.22 
 
 		 477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  38.96 
 
 		 480 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.19 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  38.61 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  39.09 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.97 
 
 		 464 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  40.13 
 
 		 480 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.62 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  37.66 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  37.45 
 
 		 483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  37.79 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.15 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 		 508 aa  303  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.8 
 
 		 486 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.72 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  37.63 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  38.31 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.34 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.17 
 
 		 491 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.45 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  37.08 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.22 
 
 		 482 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.22 
 
 		 482 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.22 
 
 		 482 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.2 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.46 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.17 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  38.46 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  37.71 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  38.22 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  37.72 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  37.1 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.74 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  36.7 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.91 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  38.19 
 
 		 497 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  38.06 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.56 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.53 
 
 		 487 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  39.19 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  37.88 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  37.28 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  37.69 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  37.98 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.12 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.99 
 
 		 487 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  39.3 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  37.58 
 
 		 490 aa  294  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.07 
 
 		 487 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.42 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.39 
 
 		 488 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  37.31 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  37.67 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>