More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000862 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  97.83 
 
 		 474 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  100 
 
 		 461 aa  954    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  47.3 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.45 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.62 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  44.97 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  44.97 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  46.22 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  46.44 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.92 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.51 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.43 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  41.29 
 
 		 490 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  41.52 
 
 		 490 aa  322  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.91 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  40.3 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  41.28 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  40.04 
 
 		 474 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.79 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.4 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.4 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.75 
 
 		 489 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.18 
 
 		 488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  39.38 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  40.75 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  40.87 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.94 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.58 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  38.22 
 
 		 469 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.09 
 
 		 475 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.73 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.34 
 
 		 480 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  37.47 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.18 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.57 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.57 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.99 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  36.64 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 477 aa  283  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  37.39 
 
 		 484 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  35.21 
 
 		 467 aa  282  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.85 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.88 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  37.45 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.97 
 
 		 497 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  35.75 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  36.67 
 
 		 490 aa  276  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  37.25 
 
 		 481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.5 
 
 		 471 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36 
 
 		 481 aa  272  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.77 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  36.83 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  36.5 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.75 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  36.67 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.75 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  36.81 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.91 
 
 		 460 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  36.12 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.55 
 
 		 476 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  36.12 
 
 		 480 aa  269  8.999999999999999e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  35.62 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.84 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  34 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 		 487 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  36.59 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  36.81 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.2 
 
 		 462 aa  267  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.73 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  36.09 
 
 		 486 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  37.03 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  36.24 
 
 		 481 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.05 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.24 
 
 		 481 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  34.78 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  35.71 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  37.19 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.75 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.75 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  35.48 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  36 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  35.05 
 
 		 477 aa  263  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  36.7 
 
 		 475 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  35.81 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.76 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  34.97 
 
 		 486 aa  263  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.18 
 
 		 496 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.3 
 
 		 496 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  35.5 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  34.13 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.44 
 
 		 490 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  35.49 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  33.48 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  36.08 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.7 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.33 
 
 		 495 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.2 
 
 		 491 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.56 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.83 
 
 		 480 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  35.04 
 
 		 497 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>