More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3769 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  81.93 
 
 		 486 aa  795    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  71.88 
 
 		 487 aa  701    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  84.8 
 
 		 486 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  76.86 
 
 		 496 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  73.33 
 
 		 486 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  70.44 
 
 		 481 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  71.67 
 
 		 498 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  100 
 
 		 487 aa  974    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  72.36 
 
 		 490 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  81.52 
 
 		 486 aa  776    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  72.8 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  72.73 
 
 		 488 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  69.73 
 
 		 496 aa  676    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  71.91 
 
 		 486 aa  692    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  72.82 
 
 		 482 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.55 
 
 		 486 aa  802    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.11 
 
 		 488 aa  686    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  80.24 
 
 		 490 aa  775    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  69.63 
 
 		 491 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  82.89 
 
 		 493 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  72.52 
 
 		 488 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  83.16 
 
 		 487 aa  811    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.1 
 
 		 496 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  81.93 
 
 		 486 aa  796    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  72.5 
 
 		 486 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.11 
 
 		 488 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.03 
 
 		 487 aa  703    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  72.58 
 
 		 488 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  70.23 
 
 		 481 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  72.59 
 
 		 498 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.52 
 
 		 488 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  72.58 
 
 		 512 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  72.58 
 
 		 488 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  81.65 
 
 		 508 aa  791    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.58 
 
 		 488 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.37 
 
 		 488 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.52 
 
 		 481 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  64.52 
 
 		 481 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  62.42 
 
 		 481 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  65.13 
 
 		 480 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  59.38 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  59.38 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  63.88 
 
 		 481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  62.16 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.05 
 
 		 481 aa  569  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  61.43 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  59.16 
 
 		 490 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  59.79 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.88 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  58.39 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  60.46 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  58.94 
 
 		 497 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  56.15 
 
 		 481 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.78 
 
 		 482 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  58.74 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  58.74 
 
 		 497 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  59.62 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.41 
 
 		 485 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.46 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  59.92 
 
 		 480 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.46 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.8 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.46 
 
 		 482 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  60.33 
 
 		 480 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.17 
 
 		 481 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.79 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.25 
 
 		 482 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.32 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  59.38 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.04 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.14 
 
 		 482 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.79 
 
 		 479 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  57.26 
 
 		 481 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  58.58 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.58 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.58 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.21 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.18 
 
 		 486 aa  541  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  59.21 
 
 		 482 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  59.46 
 
 		 482 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  58.71 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  57.68 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  58.51 
 
 		 481 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  58.71 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  58.71 
 
 		 481 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.69 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.35 
 
 		 482 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  59.58 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  60.13 
 
 		 480 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  58.65 
 
 		 481 aa  528  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  57.59 
 
 		 481 aa  529  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  57.26 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.71 
 
 		 490 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  58.51 
 
 		 480 aa  528  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>