More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0991 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  72.65 
 
 		 486 aa  691    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  74.38 
 
 		 486 aa  709    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  72.54 
 
 		 508 aa  691    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  90.53 
 
 		 486 aa  878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.33 
 
 		 487 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.54 
 
 		 486 aa  697    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  69.33 
 
 		 481 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  95.27 
 
 		 498 aa  921    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  90.33 
 
 		 487 aa  874    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  73 
 
 		 490 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  71.94 
 
 		 496 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  73.95 
 
 		 496 aa  737    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  72.5 
 
 		 487 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  82.99 
 
 		 488 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  74.37 
 
 		 496 aa  739    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  73.32 
 
 		 486 aa  724    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  82.12 
 
 		 482 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.58 
 
 		 488 aa  780    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  74.17 
 
 		 486 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.38 
 
 		 488 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  74.38 
 
 		 486 aa  710    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.38 
 
 		 488 aa  782    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  69.57 
 
 		 490 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  72.48 
 
 		 491 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  72.03 
 
 		 493 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  83.2 
 
 		 488 aa  805    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  84.22 
 
 		 488 aa  812    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  100 
 
 		 486 aa  982    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  81.12 
 
 		 498 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  90.14 
 
 		 487 aa  873    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  82.17 
 
 		 488 aa  779    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  68.91 
 
 		 481 aa  666    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  81.33 
 
 		 498 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  82.55 
 
 		 488 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  82.58 
 
 		 512 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  82.17 
 
 		 488 aa  779    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  64.3 
 
 		 480 aa  625  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  64.3 
 
 		 480 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  66.81 
 
 		 481 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  66.81 
 
 		 481 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  63.07 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.87 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  64.85 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  63.37 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  59.18 
 
 		 490 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  65.34 
 
 		 490 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  63.87 
 
 		 481 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  64.17 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.45 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  64.77 
 
 		 480 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  63.03 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  61.92 
 
 		 485 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.24 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.24 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  61.84 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.72 
 
 		 485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.54 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  63.1 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  63.75 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  59.21 
 
 		 481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  61.84 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  57.62 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  63.73 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  62.05 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.21 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  59.63 
 
 		 481 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  60.58 
 
 		 497 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.62 
 
 		 493 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  60.58 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  60.58 
 
 		 497 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  60.46 
 
 		 481 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  60.66 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.66 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  60.25 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  61.08 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  60.66 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  59.63 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  59.83 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.42 
 
 		 482 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.34 
 
 		 482 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  58.92 
 
 		 481 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  58.23 
 
 		 477 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>