More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0881 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  69.46 
 
 		 445 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 443 aa  899    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.26 
 
 		 437 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  47.52 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.79 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 		 442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  44.3 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.12 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.78 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.32 
 
 		 458 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.86 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.86 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.16 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.51 
 
 		 483 aa  246  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.96 
 
 		 469 aa  242  9e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.46 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.07 
 
 		 460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.51 
 
 		 476 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.19 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  35.36 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.03 
 
 		 461 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.73 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.98 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  33.11 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.47 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  32.81 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.06 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.19 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 462 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  35.42 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.09 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.58 
 
 		 456 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.91 
 
 		 475 aa  210  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.43 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.07 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  32.6 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  33.7 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.16 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.75 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.75 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  31.97 
 
 		 477 aa  199  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  31.41 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.19 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  30.63 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  30.63 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.77 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.5 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.79 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  31.3 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  33.03 
 
 		 479 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  30.4 
 
 		 483 aa  193  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.03 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  33.26 
 
 		 481 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  33.41 
 
 		 480 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.35 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.41 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  32.41 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  31.3 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  31.3 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.81 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.76 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.87 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  34.25 
 
 		 480 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.25 
 
 		 490 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  34.25 
 
 		 480 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.58 
 
 		 479 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.58 
 
 		 465 aa  189  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.26 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.53 
 
 		 480 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  32.54 
 
 		 482 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.63 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.97 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  32.49 
 
 		 480 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.47 
 
 		 482 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.1 
 
 		 486 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  31.52 
 
 		 484 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.87 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  31.9 
 
 		 471 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  31.29 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  31.58 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  30.87 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  30.47 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  34.09 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.64 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  30.8 
 
 		 481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  30.52 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  31.58 
 
 		 480 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  31.35 
 
 		 466 aa  183  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.66 
 
 		 482 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  32.43 
 
 		 481 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.54 
 
 		 464 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.04 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.56 
 
 		 470 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>