More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1106 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2489  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.66 
 
 
463 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3456  DNA gyrase modulator peptidase U62  75.53 
 
 
464 aa  713    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.258485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0283  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  75.42 
 
 
464 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3619  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.66 
 
 
463 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3911  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  72.3 
 
 
467 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.484753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1875  hypothetical protein  68.84 
 
 
466 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1106  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
485 aa  998    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00736821  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4478  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  69.92 
 
 
465 aa  669    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.52 
 
 
458 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.02 
 
 
461 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  42.32 
 
 
458 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.2 
 
 
460 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.91 
 
 
454 aa  269  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1015  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.28 
 
 
450 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00168617  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.44 
 
 
437 aa  228  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.33 
 
 
458 aa  226  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.89 
 
 
458 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.11 
 
 
458 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.86 
 
 
474 aa  222  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.26 
 
 
458 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.19 
 
 
443 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.87 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.54 
 
 
456 aa  196  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 
463 aa  193  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  33.9 
 
 
445 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.14 
 
 
455 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  31.58 
 
 
467 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.16 
 
 
475 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.22 
 
 
477 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.93 
 
 
460 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.5 
 
 
481 aa  169  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  30.27 
 
 
475 aa  170  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.17 
 
 
464 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.29 
 
 
459 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
481 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  33.98 
 
 
481 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.34 
 
 
443 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  31.03 
 
 
473 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.03 
 
 
473 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  29.71 
 
 
471 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.98 
 
 
460 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.48 
 
 
470 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.41 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
476 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.7 
 
 
460 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.96 
 
 
479 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 
483 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.79 
 
 
473 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  28.42 
 
 
481 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  30.31 
 
 
475 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  31.05 
 
 
491 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.28 
 
 
483 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  30.99 
 
 
498 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1164  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.56 
 
 
470 aa  161  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.82 
 
 
473 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  31.03 
 
 
486 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
475 aa  160  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 
475 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.87 
 
 
474 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.3 
 
 
486 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.3 
 
 
486 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  31.24 
 
 
460 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  27.67 
 
 
470 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 
475 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  31.25 
 
 
481 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 
462 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 
475 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  29.09 
 
 
484 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.15 
 
 
479 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  29.59 
 
 
480 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  29.59 
 
 
480 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  27.46 
 
 
470 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.74 
 
 
480 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.13 
 
 
442 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  29.21 
 
 
481 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.03 
 
 
476 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 
490 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.58 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  27.79 
 
 
481 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  28.36 
 
 
473 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.96 
 
 
490 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  33.72 
 
 
486 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
442 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.76 
 
 
462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  28.01 
 
 
490 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  29 
 
 
481 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  28.51 
 
 
481 aa  153  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  28.79 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  28.79 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  28.81 
 
 
481 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  29.79 
 
 
460 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  29.06 
 
 
481 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  28.57 
 
 
481 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>