More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2319 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0413  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  79.38 
 
 		 479 aa  761    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 480 aa  969    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.502377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1921  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  77.15 
 
 		 476 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  63.2 
 
 		 477 aa  614  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  62.37 
 
 		 480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.55 
 
 		 486 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0253  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.21 
 
 		 475 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  59.19 
 
 		 471 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  59.38 
 
 		 475 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4510  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  60.58 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  0.913937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0221  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.96 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.38 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  58.17 
 
 		 472 aa  542  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.66 
 
 		 475 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.44 
 
 		 470 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  58.23 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.66 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  58.23 
 
 		 470 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.89 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.24 
 
 		 471 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.13 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  56.89 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1223  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.14 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4322  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.22 
 
 		 479 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.88 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2337  microcin-processing peptidase 2  59.14 
 
 		 473 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.652541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.54 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.01 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0613  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.62 
 
 		 473 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.1 
 
 		 496 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2236  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.31 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0328346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.2 
 
 		 496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1825  microcin-processing peptidase 2  58.41 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0473  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  58.41 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  56.49 
 
 		 486 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.83 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  54.83 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  56.25 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.86 
 
 		 486 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3156  microcin-processing peptidase 2  57.63 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.702304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.82 
 
 		 481 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  50.95 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  58.19 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.1 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  54.04 
 
 		 481 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  53.96 
 
 		 490 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  55.65 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  56.77 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  55.23 
 
 		 480 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  55.23 
 
 		 480 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.25 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.39 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  56.32 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  59.15 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.67 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.13 
 
 		 487 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.77 
 
 		 481 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  55.67 
 
 		 481 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0998  tldD protein  50.74 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  54.18 
 
 		 486 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.57 
 
 		 481 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.36 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  54.22 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.81 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.81 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  57.81 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  56.07 
 
 		 498 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.07 
 
 		 487 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.81 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  53.35 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  55.97 
 
 		 480 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  54.66 
 
 		 477 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.46 
 
 		 480 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  55.53 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.97 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  54.66 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  55.7 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  55.7 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  55.7 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  55.9 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  57.89 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.89 
 
 		 485 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.85 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  56.08 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.26 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.22 
 
 		 488 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  50.43 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  52.66 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  55.58 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  53.05 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.4 
 
 		 482 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.48 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  54.22 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  56.25 
 
 		 480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  55.58 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  53.35 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  50.96 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  56.14 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  56.12 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  55.58 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>