More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3987 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3987  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 486 aa  985    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3846  microcin-processing peptidase 2  97.74 
 
 		 486 aa  970    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  86.34 
 
 		 489 aa  858    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3909  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  99.59 
 
 		 486 aa  982    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.23 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  44.14 
 
 		 475 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  43.66 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  45.61 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2898  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.86 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.47 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0472  TldD protein  43.99 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0623925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  42.95 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  43.46 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  44.74 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  46.31 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  41.14 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.55 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3646  microcin-processing peptidase 2  41.67 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.74 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1746  microcin-processing peptidase 2  45.11 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0412  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.21 
 
 		 485 aa  369  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.140999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.52 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2956  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.49 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  41.14 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.02 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0850  microcin-processing peptidase 2  42.89 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1027  microcin-processing peptidase 2  42.98 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.49 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.54 
 
 		 508 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  42.54 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1487  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.81 
 
 		 486 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  45.36 
 
 		 481 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  41.54 
 
 		 481 aa  362  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0991  microcin-processing peptidase 2  42.34 
 
 		 486 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1778  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.38 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  43.13 
 
 		 481 aa  361  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  44.02 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  44.02 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  43.38 
 
 		 484 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  42.18 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  41.87 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.29 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.13 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1496  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.95 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.768084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  45.15 
 
 		 480 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.15 
 
 		 490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.83 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1986  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  43.66 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.312145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.09 
 
 		 487 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  41.34 
 
 		 481 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  44.12 
 
 		 480 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  42.49 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1145  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.7 
 
 		 481 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2490  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.67 
 
 		 487 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.69 
 
 		 479 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.46 
 
 		 486 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  41.34 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.49 
 
 		 481 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  43.9 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  40.89 
 
 		 481 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  43.07 
 
 		 481 aa  349  8e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  44.64 
 
 		 480 aa  348  9e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  41.43 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1093  microcin-processing peptidase 2  42.27 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4561  protease TldD  42.51 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.657779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  41.87 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  40.99 
 
 		 481 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  41.87 
 
 		 481 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  41.13 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  41.87 
 
 		 481 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03104  predicted peptidase  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0462  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3540  protease TldD  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3433  protease TldD  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03055  hypothetical protein  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3727  protease TldD  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0462  protease TldD  41.06 
 
 		 481 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.962862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.09 
 
 		 481 aa  345  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0276  microcin-processing peptidase 2  40.04 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3276  protease TldD  41.06 
 
 		 481 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  42.4 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  40.94 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.97 
 
 		 488 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  42.8 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  40.64 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  40.64 
 
 		 481 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.89 
 
 		 490 aa  341  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.76 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  40.64 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.28 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  40.64 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3769  TldD protein  42.95 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162647  normal  0.0283692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.28 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  40.43 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0512  putative modulator of DNA gyrase  43.72 
 
 		 490 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  41.91 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  41.91 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  41.91 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  41.91 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  41.91 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>